Der geheime Ausgang von Escape from the factory öffnet fünf zusätzliche Fabrikmissionen. Das Finale besitzt eine eigene Kampfmechanik gegen Captain Syrup.
Mission 1: Defeat the giant spear man – Die versteckte Fabrik
Dieses Kapitel beginnt am geheimen Ausgang von In Town 4-4. Der Weg führt über mehrere Etagen und drei Kellergeschosse. Halte bei den Schneemännern Abstand und warte in den senkrechten Schächten auf eine zusammenhängende Folge von Liftplattformen. Bewege Dich über kurz tragende Plattformen sofort weiter, statt mitten im Schacht stehen zu bleiben.
Im großen Aufzugsraum nahe dem Abschnittsende nimmst Du für die Schatzkammer den vierten Aufzug von links. Er trägt Dich zur höher gelegenen Tür. Der dritte Aufzug führt dagegen zum großen Speerpiraten. Hole den Schatz zuerst und fahre danach zum Boss. Bleibe beim Kampf möglichst von den Treppen fern: Auf der ebenen Fläche lässt sich der umgestoßene Gegner besser mit wiederholten Stampftreffern kontrollieren. Der reguläre Abschluss setzt den alternativen Fabrikweg fort.
Mission 2: Into the factory! – Platt durch die Anlage
Der Weg steigt im Pinguinbereich über die oberen Plattformen weiter. Halte vor den geschosswerfenden Gegnern eine freie Ausweichfläche bereit und benutze die Stampfattacke, um sie zu unterbrechen. Die späteren Gewichte machen Dich zu Platt-Wario. Gleite damit durch die niedrigen Wege nach unten und suche die Fledermaus, die Dich wieder aufrichtet.
Der Schatz liegt im großen Raum mit der normalen Zieltür, oberhalb der Grube rechts von der gewichttragenden Fledermaus am Raumeingang. Für diese Tür musst Du normal geformt sein. Hole sie deshalb, bevor Du Dich platt drücken lässt. Wirst Du versehentlich getroffen, gleite nach unten zur Heilung zurück und steige erneut zum Schatzabsatz auf. Nach dem Minispiel benutzt Du die Plattform- und Gleitroute zur regulären Zieltür.
Mission 3: Move through the water! – Die Strömung abstellen
Benutze die Schalter, um Strömungen und Wasserwege zu verändern. Im ersten Bereich musst Du einen Gegner gegen die markierte Barriere werfen, bevor Du an den Schalter kommst. Durchquere die nun zugängliche Wassertür und arbeite Dich zum weiter rechts liegenden Schalter vor. Die veränderte Wasserhöhe öffnet im vorherigen Raum einen zuvor unerreichbaren Zugang.
Für die Schatzkammer im Raum vor dem Zielbereich reicht bloßes Gegenschwimmen nicht: Die Strömung sperrt die Unterwassertür. Gehe erst bis in den Raum mit der regulären Zieltür und betätige den dortigen Schalter. Kehre danach einen Raum zurück. Jetzt erreichst Du die vorher versperrte Schatzkammertür. Die Feuerblöcke auf der Schlussroute öffnest Du mit der vollständigen Feuerballform. Betrete den normalen Ausgang erst nach dem Schatz-Rückweg.
Mission 4: Don’t shock the owl! – Eulenlabyrinth und Gegnerblöcke
Die Eulen verbinden die Zugänge des großen Raums. Fliege in freien Bögen zwischen den elektrisch geladenen Gegnern hindurch und achte auf Warios Körper unter der Eule. Bei einer engen Passage bringt eine langsamere Anflugrichtung mehr als wiederholtes Beschleunigen. Die verschiedenen Türen führen zu Schaltern und Münzräumen; der obere rechte Teil setzt die Route zum Ausgang fort.
Der Schatz und die reguläre Zieltür liegen im selben Schlussraum. Hebe den Speerpiraten auf und trage ihn über die rechten Plattformen bis unter die Decke. Hinter einer Wand aus Gegnerblöcken liegt die Schatzkammertür. Wirf den Piraten gegen die Barriere und gehe erst danach in die Kammer. Lass ihn nicht schon unten in einen Abgrund fallen: Ohne Wurfgegner bleibt der markierte Weg geschlossen. Nach dem Schatz kehrst Du auf den normalen Ausgangsabsatz zurück.
Mission 5: Awaiting Syrup! – Syrups fliegende Teetasse
Die Fackelgegner öffnen mit Deiner Feuerballform den Weg durch die weißen Aufblasgegner und die Feuerbarrieren. Im späteren Raum mit den Hammeraffen und den fünf Schächten lässt Du Dich zur Springform zusammendrücken. Springe in die zweite Kammer von rechts, also die vierte von links. Warte dort, bis Du wieder normal bist. Links liegt die Schatzkammer mit dem Game-Boy-Schatz.
Der Kampf gegen Captain Syrup funktioniert hier anders als im Schloss. Ihre fliegende Teetasse ist zunächst durch eine Glaskuppel geschützt. Ramm sie bei ihren tiefen Anflügen dreimal von der Seite, um das Glas zu zerbrechen. Danach wirft sie Bomben ab. Springe auf eine Bombe, hebe sie auf und wirf sie direkt gegen Syrup. Drei Bombentreffer gewinnen diese Phase. Halte Dich zwischen den Angriffen vom Feuerboden und den elektrischen Hindernissen fern. Die Feuersäulen-Taktik des normalen Schlossfinales gilt in diesem Kampf nicht.